Consecventă tradiției sale universitare, Academia își asumă și misiunea de asimilare a valorilor culturii naționale și universale și se implică în procesul de consolidare a spiritualității europene.
Pornind de la misiunea instituției, Programul Managerial al Rectorului 2024-2029 prezentat la alegerile universitare și asumat de comunitatea academică și ținând cont de cerințele beneficiarilor și recomandările instituțiilor de evaluare externă a calității, întreaga activitate desfășurată este orientată către realizarea obiectivelor strategice formulate.
ANMB are un Plan strategic de dezvoltare instituțională în care sunt cuprinse obiective strategice, implementate prin Planuri operaționale anuale. Gradul de îndeplinire a acestor planuri operaționale anuale reprezintă criteriu de apreciere în evaluarea performanțelor conducerii și administrației.
Obiectivele educaționale sunt legate de formarea de competențe specifice pentru studenți, în calificarea lor, prin promovarea unui învățământ de calitate și tratarea studenților ca parteneri în educație.
ANMB are un Cod al eticii și integrității academice prin care apără valorile libertății academice, autonomiei universitare și integrității etice, dispune de practici și mecanisme clare pentru aplicarea codului și prevede modalități de control al aplicării codului.
Senatul reprezintă comunitatea academică și este cel mai înalt for de decizie și deliberare la nivelul instituției. Senatul își exercită funcțiile prin intermediul regulamentelor, metodologiilor și hotărârilor ale căror prevederi sunt obligatorii pentru întreaga comunitate academică. Toate persoanele cu funcții de conducere academică și administrativă au obligația de a răspunde interpelărilor Senatului la problemele care interesează comunitatea academică.
ANMB are un sistem de conducere coerent, integrat și transparent, bazat pe o administrație eficace și eficientă, adaptată misiunii și obiectivelor asumate. Astfel, ANMB este condusă operativ de către Consiliul de administrație pe baza Regulamentului de funcționare.
Reprezentanții studenților sunt aleși prin vot universal, în conformitate cu prevederile Regulamentului activității profesionale a studenților și Cartei Universitare, pentru a face parte din consiliile facultăților, Senat și comisiile Senatului.
ANMB răspunde în fața autorității publice pentru: calitatea activității didactice și de cercetare, asigurarea libertății academice, respectarea legislației în vigoare, a politicilor naționale și europene în domeniul învățământului superior, pentru transparența deciziilor, respectarea normelor de etică universitară și gestionarea eficientă a resurselor.
ANMB este un pol de expertiză universitară în viața publică constănțeană prin participarea sa activă în domeniile sale de competență și în domeniile conexe. Acest lucru este realizat prin intensificarea relațiilor de colaborare pe care le are deja cu autoritățile și instituțiile locale și regionale. Facultățile beneficiază de libertate academică în domeniile didactic și științific, potrivit Cartei Universitare și regulamentelor proprii.
Prin colaborarea sa cu alte instituții din zona Dobrogei și transfrontalieră, ANMB este un factor integrator în implementarea politicilor Uniunii Europene în regiunea de Sud-Est a României. Abilitatea de schimbare și dezvoltare a fost deja dovedită prin implementarea și menținerea unui sistem de management al calității de peste 15 ani, atunci când acest fapt nu era în atenția multor universități din România.